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Le microbiome et les infections virales

Cet article met en relation différents profils de microbiote avec une sévérité plus ou moins grande de la clinique, lees lésions et de la charge virale dans une infection conjointe avec les virus SDRP et PCV2, ce qui ouvre une fenêtre d'opportunités.

Mercredi 8 Novembre 2017 (il y a 15 jours)

Article

Rebecca A. Ober, James B. Thissen, Crystal J. Jaing, Ada G. Cino-Ozuna, Raymond R.R. Rowland, Megan C. Niederwerder. Una mayor diversidad en la microbiota en el momento de la infección se asocia con mejores tasas de crecimiento en cerdos después de la coinfección con el virus del síndrome respiratorio y reproductivo porcino (PRRSV) y el circovirus porcino tipo 2 (PCV2). 2017. Veterinary Microbiology vol 208, pag 203 http://dx.doi.org/10.1016/j.vetmic.2017.06.023

Qu'est-ce qui est étudié?

L'objectif de l'étude était d'étudier l'influence du microbiote sur les résultats cliniques et de production après des co-infections virales chez le porc.

Comment est-ce étudié?

L'hypothèse était que, chez les porcs, une augmentation de la diversité du microbiote intestinal fournit une plus grande résistance aux infections virales respiratoires subcliniques. L'étude a utilisé cinquante porcs de 3 semaines négatifs en SDRPv, issus d'un élevage positif en PCV2. Les échantillons fécaux recueillis au début de l'essai ont été envoyés pour analyse du microbiote. La diversité du microbiote a été déterminée en calculant le nombre de familles et d'espèces détectées chez chaque porc. À l'âge de 8 semaines, après une infection expérimentale avec le SDRPv et le PCV2, les résultats cliniques, la virémie et le poids ont été enregistrés. Pour assurer l'analyse des infections subcliniques, tous les porcs nécessitant une intervention vétérinaire ont été exclus de l'essai. A 35 jours après l'infection, les 40 porcs restants ont été pesés et classés en deux groupes, le taux de croissance élevé et faible, en fonction de leur GMQ depuis l'inoculation jusqu'à 35 jours post-infection. Au jour 42 après l'infection, tous les porcs ont été pesés, euthanasiés et un examen post-mortem détaillé a été réalisé. L'évaluation macroscopique et microscopique des lésions pulmonaires a été notée de 0 à 4. L'évaluation microscopique de la déplétion lymphoïde a été notée de 0 à 3. les notes les plus élevées reflètent une pathologie plus grave.

Quels sont les résultats?

  1. Le gain de poids après co-infection était différent dans les groupes ayant un GMQ faible (0,775 + 0,075 kg) et un GMQ élevé (0,903 + 0,043 kg). Sur les 50 porcs infectés par le SDRP et le PCV2, 10 ont nécessité un traitement (20% de morbidité). Le poids final était statistiquement différent entre les deux groupes (52,5 + 5,3 kg contre 57,1 + 2,9 kg, p = 0,028).
  2. Le groupe à taux de croissance élevé avait une plus faible réplication du SRRP, statistiquement significative, mesurée par l'aire sous la courbe à 42 jours. Les données du PCV2 ont montré une grande variation, mais ont indiqué une tendance à la réduction de la virémie dans le groupe à taux de croissance élevé.
  3. Les porcs ayant un taux de croissance élevé présentaient des lésions pulmonaires moins sévères.
  4. Au total, 29 familles et 112 espèces microbiennes ont été détectées. Le microbiote à des porcs croissance élevée avait une plus grande diversité, une plus grande proportion de Firmicutes: Bacteriodetes, plus Rumincoccaciae, Streptococcaceae et moins de Methanobacteriaceae.

Quelles conclusions peut-on tirer de ce travail ?

La diversité et la composition du microbiote peuvent influencer les résultats cliniques et la productivité après les infections à PRRSV et PCV2 chez les porcs.

L'étude confirme l'impact sur la croissance des co-infections par le SDRP et le PCV2 même lorsque les porcs ne présentent aucun signe clinique manifeste.

<p>Enric Marco</p>
La vision du terrain par Enric Marco

C'est incroyable de voir en direct comment la science évolue. Nous avons toujours cru que le maintien de la santé intestinale était bénéfique, mais nous n'aurions jamais imaginé à quel point cela pouvait être important. Avec les techniques de biologie moléculaire dont nous disposons aujourd'hui, il est possible d'étudier le microbiote plus en détail et donc d'établir des relations avant impossibles. Les premiers travaux qui font le lien entre des changements dans le microbiote avec des problèmes de santé, autres qu'intestinaux, apparaissent en médecine humaine, en étudiant spécifiquement certains des problèmes qui apparaissent chez les patients infectés par le virus du SIDA. Chez ces patients, une relation a été trouvée entre certains profils de microbiote et le développement de ce que l'on a appelé le vieillissement précoce. En médecine vétérinaire des articles faisant le lien entre le microbiote des porcelets de quelques jours de la vie et la prédisposition à subir ou non les processus de diarrhée post-sevrage avaient déjà été publiés; mais cet article fait le lien entre les différents profils de microbiote avec une sévérité plus ou moins importante en clinique, les lésions et la charge virale dans une infection conjointe avec les virus SDRP et PCV2, ce qui ouvre une fenêtre d'opportunités.

La manipulation possible du microbiote intestinal pourrait être un outil très utile en clinique porcine, en particulier en ces temps où la réduction de l'usage des antimicrobiens n'est plus une envie pour certains mais une nécessité pour tous. Cependant, et malheureusement, nous ne savons toujours pas comment le manipuler pour qu'il change vers à un profil en particulier. Je pense à beaucoup de méthodes à tester . Des techniques de transplantation fécale pourraient-elles être appliquées aux porcs comme celles qui sont appliquées aux humains? Devrions-nous faire le feed-back différemment de ce que nous faisons aujourd'hui, c'est-à-dire en utilisant des excréments d'animaux en bonne santé et pas de malades ? Pourrions-nous manipuler le microbiote des porcelets en changeant celui de leurs mères?

Je me souviens d'un discours de Fernando Fariñas dans lequel il soulignait l'importance du système immunitaire intestinal, je crois me souvenir qu'il disait que 70% des cellules du système immunitaire étaient dans l'intestin. Au vu des résultats de la présente étude, il semblerait que selon le profil du microbiote, la réponse immunitaire serait favorisée ou non en présence de certains processus. Et éventuellement, dans le futur, nous saurons si ces profils de microbiote doivent être différents pour améliorer la réponse aux différents processus, ou pour atteindre un profil spécifique et améliorer la réponse immunitaire contre tout. Je ne doute pas que ce type de travail nous offre un monde d'opportunités que nous verrons probablement se réaliser dans les années à venir.

Du laboratoire à l’élevage

Commentaires de l'article

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