Le meilleur échantillon antemortem pour la détection de la grippe est :

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Les fluides oraux contiennent des inhibiteurs qui peuvent affecter la détection par RT-PCR et en outre la présence de petites quantités de virus peut empêcher l'isolement ou le séquençage. Normalement les écouvillons nasaux fonctionnent souvent mieux pour détecter et isoler la grippe en raison des grandes quantités de virus dans ces échantillons, mais cela nécessite la récolte individuelle sur un nombre d'animaux suffisant pour représenter la population en phase d'infection.