Cas clinique - Dépopulation : le poids du streptocoque !

L'exploitation concernée compte environ 2 500 truies en "cycle ouvert" et est située dans une zone à forte densité porcine. Les porcelets sont sevrés à l'âge de quatre semaines et emmenés vers des post-sevrages extérieurs. En fonction de la capacité, les PS sont remplis de porcelets entre deux et trois semaines après le sevrage. Au fil des ans, le repeuplement est passé d'un système externe à un système d’auto-renouvellement avec l'introduction de la semence uniquement pour la lignée mâle.

Les animaux sont régulièrement vaccinés contre le SDRPv. L'exploitation est bien structurée et gérée du point de vue de la biosécurité externe, comme le montre la photo (Fig. 1) : aucun véhicule ne pénètre dans la zone propre et aucune personne n'entre sans passer par la zone de filtrage équipée d'une douche et de vêtements spécifiques ; le chargement des cadavres s'effectue dans la zone externe.

Située dans une zone à forte densité, cette exploitation a été, et est toujours, instable par rapport au SDRPv ; en fait, une nouvelle souche de SDRPv entre dans l'exploitation deux fois par an en moyenne, ce qui a des répercussions sur les aspects reproductifs des truies, mais surtout sur l'augmentation de la mortalité dans les post-sevrages.

L'augmentation de la mortalité, dans les semaines qui suivent immédiatement l'apparition d'un foyer, est due à la mauvaise qualité des porcelets sevrés. Dans les semaines suivantes, l'augmentation de la mortalité n'est pas tant, ou du moins pas uniquement, due à l'augmentation des symptômes respiratoires causés par le virus du SDRP, mais principalement à l'augmentation des infections bactériennes secondaires : Escherichia coli, Glasserella parasuis, et surtout Streptococcus suis.

Depuis 2018, avec l'adaptation des lignes directrices sur l'utilisation prudente des antibiotiques, la recherche et les essais visant à réduire la mortalité des animaux sevrés tout en diminuant l'utilisation des antibiotiques et en abandonnant l'utilisation des antimicrobiens d'importance critique (AIC) se sont intensifiés.

Si les problèmes de diarrhée liés à la mise bas et au post-sevrage (E. coli) ont entraîné des pertes relativement faibles et une utilisation modérée d'antibiotiques, ce n'est pas le cas pour S. suis.

L'utilisation de pénicillines (amoxicilline) a été nécessaire tant pendant la lactation, avec plusieurs interventions intramusculaires, qu'au sevrage par voie orale et intramusculaire, avec une consommation bien supérieure à nos objectifs (voir Fig 2 et 3). Et malgré leur utilisation en tant que thérapie et métaphylaxie, les pertes étaient encore clairement élevées.

Après avoir testé l'utilisation d'un autovaccin à base d'hydroxyde d'aluminium en 2018 sans amélioration, il a été décidé de mener en 2020 un projet d'analyse détaillée des souches circulantes chez les truies et les porcelets sevrés.

Il en est ressorti que le sérotype circulant tant chez les truies que chez les porcelets sevrés était Streptococcus suis sérotype 9. Parallèlement, les facteurs de virulence associés à ce sérotype ont également été évalués. Plusieurs facteurs de virulence sont exprimés par S. suis. Les plus importants sont la protéine de libération de la muramidase (mrp), codée par le gène mrp, le facteur extracellulaire (ef), codé par le gène epf, et la toxine suilysine (hémolysine), codée par le gène sly (Silva et al., 2006).

Notre sérotype étant toujours associé aux facteurs de virulence mrp et sly, comme le montre le tableau (tableau 1), nous avons également essayé d'utiliser un autovaccin fabriqué à partir du sérotype 9 avec le Montanide comme adjuvant. Le protocole prévoyait une double vaccination des truies et éventuellement une vaccination des porcelets.

Tableau 1 : Isolats chez les truies et les porcelets sevrés : sérotype, facteurs de virulence et sensibilité aux antimicrobiens (S = sensible, R = résistant, I = intermédiaire).

Cet essai n'a pas non plus permis d'obtenir une amélioration significative en termes de réduction de la mortalité et/ou de réduction des antibiotiques.

D'autres essais ont été menés entre 2018 et 2021 : utilisation de monolaurine, d'agents acidifiants, de vaccins commerciaux. Aucun d'entre eux n'a conduit à des améliorations.

L'évolution sanitaire, notamment chez les porcelets sevrés, n'a pas atteint les objectifs : les pertes économiques sont dues à la fois à la mortalité et à la dépréciation des porcelets qui n'ont pas pu être vendus au prix du marché (Fig. 4). Au cours de la dernière année analysée (2020-2021), 15 % des animaux sevrés n'ont pas été vendus ou n'ont pas été vendus au prix du marché. En outre, l'objectif de réduction de l'utilisation d'antibiotiques n'a pas non plus été atteint.

A l'automne 2021, il a été décidé de procéder à un dépeuplement/repeuplement total de l'élevage afin de " réinitialiser " la charge bactérienne de l'élevage. Nous ne pouvions pas faire grand-chose contre le virus SDRP, notre objectif était de limiter les co-infections bactériennes secondaires.

En accord avec la société de génétique qui devait fournir les animaux reproducteurs, une pyramide de production a été identifiée pour répondre aux besoins du client. Un screening approfondi, notamment pour S. suis, a ensuite été réalisé :

• 60 écouvillons laryngés ont été prélevés à différents âges des porcelets, où ils peuvent être plus sensibles à l'infection (5 à 12 semaines d'âge).
• Un milieu de transport Amies + charbon actif a été utilisé (sensibilité de détection plus élevée).
• Sur les 60 échantillons, 45 isolats ont été obtenus, qui ne correspondaient pas aux souches de Streptococcus 1, 2, 4, 7 et 9 (liées à des cas cliniques).
• Seuls 4 des 45 isolats de S. suis non typables présentaient l'un des 3 facteurs de virulence streptococciques (epf, mrp ou sly), mais aucun ne présentait les trois à la fois.

Il semblait peu probable que les animaux de cette pyramide de production puissent présenter une clinique de méningite streptococcique. De plus, dans cette pyramide de production, l'utilisation d'aminopénicillines était pratiquement inexistante.

Confortée par cette enquête épidémiologique, l'arrivée des animaux a été planifiée.

Les premières mises bas ont eu lieu au début de l'année 2023. C'est précisément au moment du premier sevrage que l'élevage a été touché par une nouvelle souche de SDRPv. Malgré cela, les données disponibles à ce jour sont rassurantes en termes de mortalité (Fig. 5) et d'utilisation d'antibiotiques (Fig. 6). Ainsi, malgré le fait que les premiers lots ont démarré avec des porcelets nés après une épidémie de SDRP et que les lots fermés analysés étaient entièrement composés de porcelets provenant d'animaux primipares, on observe une tendance à la mortalité inférieure d'environ 50% à celle de la période précédente.

Lors de la prise de décision et de la définition du plan d'entreprise, des valeurs tangibles et mesurables telles que l'amélioration des performances de production et les économies de médicaments ont été prises en compte, mais en même temps, les aspects éthiques et donc le respect des lignes directrices sur l'utilisation prudente des antimicrobiens ont également été pris en compte de manière décisive. L'élevage avait besoin de travaux d'entretien/d'adaptation et a donc été fermé plus longtemps que d'habitude.

Bien qu'il puisse y avoir des variations considérables en fonction du calendrier du marché, en tenant compte de la période minimale de dépeuplement/repeuplement et en excluant les travaux extraordinaires, un retour sur investissement est attendu dans environ 2,5 à 3,5 ans, déduction faite des frais d'intérêt.